El Centro de Estudios en Biodiversidad ha planificado el desarrollo de diversas bases de datos, entre las que destacan:
Catálogo de las Colecciones Biológicas del Centro, para permitir y facilitar su uso (actualmente en desarrollo).
Inventarios de especies de diversos grupos de organismos (nacional y regional), con amplias aplicaciones en investigación, educación y difusión (actualmente en desarrollo).
Base Bibliográfica Digital, una biblioteca especializada en biodiversidad (principalmente taxonomía de grupos variados, biogeografía, etc.), compuesta principalmente por artículos en formato pdf, disponible bajo solicitud por correo electrónico, para uso estrictamente personal.
Archivo fotográfico, reúne imágenes de diferentes componentes de la diversidad biológica chilena (actualmente en desarrollo).
